Auch wenn die Querflöte zu den Holzblasinstrumenten zählt, haben die Flötisten doch zum Glück nicht im gleichen Maße wie andere Holzbläser mit »holzblastypischen« Ärgernissen und Problemen zu kämpfen (wie beispielsweise Risse oder Sprünge im Holz), da ja die Flöte aus meist edlem Metall ist. Dennoch gibt es auch bei Flöten einige häufig vorkommende Schwierigkeiten, die sich aber fast alle mit kleinen Tricks bekämpfen lassen.